Description du projet
- Titre du projet : Reappraisal of cancer morphology and its cellular and transcriptional determinants with unsupervised artificial intelligence, single nuclei and spatial transcriptomics
- Année de sélection : 2020
- Institution : ULB
- Montant octroyé : 337 424 €
- Durée du financement : 4 ans
L’invention du microscope au XVIIIème siècle a révélé la cellule—composant élémentaire des tissus—et donné naissance à l’histopathologie. Les histopathologistes modernes analysent l’arrangement spatial des cellules dans les tumeurs afin de diagnostiquer et classer les cancers. Leur art reste cependant qualitatif et teinté de subjectivité. Notre allons contribuer à fonder l’histopathologie sur des bases quantitatives et objectives et découvrir systématiquement les types de cellules associées aux différentes formes tumorales visibles au microscope. Pour cela, nous allons recourir à l’intelligence artificielle pour analyser des millions d’images de tissus cancéreux afin d’en quantifier les caractéristiques. Nous allons, en parallèle, analyser le transcriptome intra-tumoral, c’est à dire l’état moléculaire des tumeurs. Notre recherche portera sur les cancers du pancréas et les cancers de la thyroïde anaplasiques et papillaires. L’agressivité des deux premiers est extrême. Cette approche permettra de mieux comprendre comment les cellules cancéreuses interagissent avec leur microenvironnement.
